Pierwszymi odnotowanymi w źródłach właścicielami Zbyszyc był rycerski ród Kępińkich herbu Niesobia. To właśnie członek tegoż rodu, Bartłomiej, ufundował w 1242 r. pierwszy, drewniany kościół pod wezwaniem św. Wojciecha. W I poł. XV w. został wybudowany stojący do dziś na zboczu Dąbrowskiej Góry murowany z białego kamienia kościół p.w. św. Bartłomieja, który oprócz funkcji sakralnych pełnił również rolę niewielkiej warowni obronnej. Jako fundatora kościoła, kroniki podają chorążego wieluńskiego Wierzbiętę Kępińskiego. Konsekracja miała miejsce w 1447 r.
Przez całe wieki kościół był centrum zamożnej parafii obejmującej najpierw wieś a następnie miasto Zbyszyce. Trwało to do 1934 r., kiedy to ogromna powódź zniszczyła znaczną część Zbyszyc. Aby zapobiec kolejnym katastrofalnym powodziom w roku 1935 rozpoczęto budowę sztucznego zbiornika zwanego obecnie Jeziorem Rożnowskim, który pochłonął niemal całą miejscowość.
Dzieje kościoła były równie burzliwe jak dzieje Sądecczyzny. W XVI w. Znaczna część miejscowej ludności przeszła na arianizm, co przyczyniło się do zniszczenia wyposażenia kościoła. Jednak największe zniszczenia miały miejsce w roku 2003, kiedy to pożar zniszczył drewnianą wieżę, kryty blachą XVIII-wieczny dach kościoła wraz ze sklepieniem pokrytym polichromią oraz dzwonnicę z XVIII w. Z pożaru udało się ocalić część zabytkowego wyposażenia, w tym cenne obrazy. Po pożodze został odbudowany jedynie dach, któremu przywrócono krytą gontem formę z XVII w.
Kościół ma konstrukcję jednonawową bez transeptu. Od strony ołtarza zamknięty jest czworoboczną absydą. Mury wzmocnione są szkarpami. Prezbiterium przykryte jest typowym gotyckim sklepieniem krzyżowo-żebrowym. W zwornikach sklepienia umieszczone są tarcze herbowe, w tym herb Kępińskich – Niesobia. Po lewej stronie ołtarza wmurowano w ścianę płytę nagrobną Mikołaja Kępińskiego z 1490 r. Ściany ozdobione są XVII-wiecznymi polichromiami z wizerunkami świętych. Kamienna chrzcielnica pochodzi z wieku XVIII a jej gotycka podstawa z wieku XV. W lunecie sklepienia zachowała się pochodząca z I poł. XVII w. polichromia przedstawiająca św. Świerada z Tropia – miejscowego pustelnika. Cenne freski znajdują się również w zakrystii.
W kościele trwają prace konserwatorskie mające na celu przywrócenie dawnej świetności świątyni. Odkrywane są też kolejne freski.