Założony w 1800 r., po nakazie zamknięcia starego cmentarza, znajdującego się w mieście. Chowani są tu do dziś wszyscy krakowscy Żydzi. Wielu z nich było znanych i cenionych, wielu pozostawiło swoje dzieła dla potomnych. W czasie II wojny światowej zdewastowany, został odrestaurowany w latach 50. XX w. Przy wejściu znajduje sie pomnik przypominający o losach Żydów krakowskich w czasie II Wojny Światowej. Wmurowano w niego tablice grobowe (macewy), z których Niemcy kazali ułożyć chodniki w obozie w Płaszowie. Pomnik bywa nazywany krakowską ścianą płaczu.
Przy wejściu na cmentarz, po lewej stronie, znajduje się wciąż działający dom przedpogrzebowy. Nagrobki zwyczajem żydowskim są umieszczone w nieładzie. Niektóre uległy sporym zniszczeniom. Zgodnie z tradycją, pochowani należą już do Boga, więc dbałość o ziemskie świadectwa ich istninia nie jest tak ważna. Podczas zwiedzania cmentarza warto zwrócić uwagę na wspaniałe rzeźby nagrobne charakterystyczne dla żydowskiej sztuki wanitatywnej: korony, lwy, jelenie, gwiazdy Dawida czy połamane drzewa.