W bezpośrednim sąsiedztwie Stogu Izerskiego znajduje się „Specjalny Obszar Ochrony Siedlisk Natura 2000”. Są to „Torfowiska Gór Izerskich”.
Obszar ten zatwierdzony jest Decyzją Komisji Europejskiej. Zajmuje powierzchnię 4765 ha i stanowi największy w Polsce kompleks torfowisk wysokich i przejściowych. Jest tam sześć siedlisk, z których najcenniejszymi elementami są bory bagienne oraz torfowiska wysokie pokryte sosną.