Pierwsze wzmianki o wsi Brudzew pochodzą z połowy XIII w. Prawa miejskie nadano mu prawdopodobnie w połowie XV w., najstarsze pisane informacje o mieście znaleźć można w dokumentach z 1511 r.
Największy rozkwit miejscowość zawdzięcza wojewodzie poznańskiemu Stanisławowi Górce oraz rodzinie Radolińskich. Przywilejów miejskich pozbawił Brudzewa dekret carski z 1870 r. W 1546 r. ówczesny właściciel Brudzewa, Mikołaj Jarand, ufundował szpital. Być może przy nim istniała kaplica, którą w 1680 r. zastąpił murowany kościół zbudowany z inicjatywy Radolińskich.
Barokowa świątynia p.w. Świętego Ducha i św. Jakuba, obok kościoła parafialnego do dziś stanowi jedną z dwóch głównych atrakcji wsi. W 1868 r. skrócono długość budowli po zawaleniu się części sklepienia.
Kościół szpitalny w Brudzewie jest zabytkiem chronionym decyzją konserwatorską nr 46/428 z 21.12.1953 r., wpisanym do rejestru NID pod identyfikatorem 656622.