Port został wybudowany pod koniec XIX w. W 1888 r. uruchomiono stocznię rzeczną i bocznicę kolejową. Port miał charakter remontowy, ale stanowił również ważny element Twierdzy Toruń będąc przystanią eskadry monitorów rzecznych i jednostek pomocniczych. Obecnie mieszczą się w nim warsztaty naprawcze i przystań wioślarsko-żeglarska AZS. Powierzchnia basenu portowego to ok. 5 ha.