Katolicy z rejonu Smętowa należeli na początku XX w. do parafii Lalkowy i Luchowy. W 1936 roku wystąpili do biskupa chełmińskiego o utworzenie nowej parafii, co stało się faktem rok później. Wierni rozpoczęli budowę świątyni, ale dzieło zostało przerwane przez wybuch wojny. Po wojnie i towarzyszących jej przesiedleniach w Smętowie pozostał kościół należący do wspólnoty ewangelickiej, wybudowany (wraz z plebanią) w 1904 r. Budynki te przejęła parafia katolicka, zaś jej tymczasową siedzibę zajął Skarb Państwa.
Ciekawostką jest, że konstrukcja chóru wykonana jest z materiału rozbiórkowego po zniszczonym podczas wojny moście kolejowym w Opaleniu.