Gmach główny muzeum mieści się przy ulicy Mariackiej 25/27. W ofercie muzeum dla zwiedzających znajdują się wystawy stałe: m.i. z doliny Nilu, gdzie możemy zobaczyć oryginalne obozowisko i sprzęty codziennego użytku z Sudanu. Muzeum eksponuje także pradawne dzieje Pomorza, 1000- letnią historię Gdańska w świetle wykopalisk.
Ciekawostką jest wystawa - "Schorzenia ludności prahistorycznej na ziemiach polskich". Możemy tu zobaczyć ślady złamań i urazów na wykopanych kościach, a także ślady po pradawnej trepanacji czaszki.
Warto zwrócić uwagę na wielki róg tura, wyobrazić sobie, jak wielkie to musiało być zwierzę. Znajdujemy tu ekspozycję naczyń glinianych, pierwszych narzędzi, ozdób ciała, makietę grodu. Ciekawa podróż w przeszłość.
Dodatkową atrakcją jest wieża widokowa, z której widać znakomitą panoramę Starego Miasta i najpiękniejsze zabytki Gdańska.
Muzeum jest czynne codziennie, oprócz poniedziałków, natomiast na wieżę widokową można wejść także w poniedziałki.