Historia parafii św. Franciszka z Asyżu rozpoczęła się w 1887 roku, kiedy kanonik wrocławski dr. Franz objął część gruntów w miejscowości Dittersbach (dawna nazwa obecnej dzielnicy Wałbrzycha - Podgórze) i w 1888-1889 przebudował salę taneczną gospody na kościół pomocniczy św. Franciszka. Właścicielem obiektu została Kuria Biskupia we Wrocławiu.
28 listopada 1889 roku kościół został poświęcony nadając mu patrona św. Franciszka z Asyżu. Liczba parafian ciągle wzrastała i w roku 1908 osiągnęła poziom 6420 wiernych. Najważniejszą jednak datą w historii kościoła jest 2 lipca 1933 roku, kiedy rozpoczęto rozbudowę i przebudowę . W 1936 roku poświęcono mozaikę z obrazem św. Franciszka, która znajduje się nad wejściem do kościoła. Prace trwały do 1937 roku, kiedy w dzień Bożego Narodzenia kościół został poświęcony. Koszt budowy wyniósł około 81 tyś marek.
Na wieży kościelnej umieszczono trzy dzwony o nazwach: Ave Maria, Św. Franciszek oraz Trójca Święta. W czasie II wojny światowej zostały one zabrane na cele zbrojeniowe. Obecnie na wieży znajdują się dwa dzwony. 3 maja 1959 roku poświęcona została Grota Matki Bożej na placu przed kościołem. Znajduje się też tu pomnik górników i kolejarzy poświęcony 26 listopada 2006 roku. 14 listopada 1945 roku zapoczątkowana została praca duszpasterska Pallotynów która trwa do dnia dzisiejszego