Muzeum pamięci ofiar faszyzmu w Ponarach jest zbudowane w miejscu masowej zagłady mieszkańców Wilna i okolic podczas okupacji niemieckiej od lipca 1941 r. do lipca 1944 r. W tym okresie w Górnych Ponarach, na terenie przechowalni paliw, hitlerowcy zamordowali ponad 100 000 osób. Zginęło tu ponad 70 000 wileńskich Żydów, a wśród nich tak wybitne postacie jak Kazimierz Pelczar i Mieczysław Gutkowski z Uniwersytetu Stefana Batorego.
W Ponarach pomordowano również tysiące Polaków oraz jeńców radzieckich różnej narodowości. Po wojnie, w 1948 r. postawiono tu pierwszy pomnik ku czci pomordowanych. A w 1960 r. otwarto muzeum. Jego eksponaty nawiązują głównie do historii holocaustu na Litwie. Następny pomnik postawiono w 1989 r. ku czci pomordowanym Żydom. Kolejny pomnik w 1991 roku poświęcono Polaków, oraz następny w 1993 r. – Litwinom.
Muzeum mieści się przy Agrastų gatvė 15. Czynne od 1 marca do 1 grudnia 11.00-18.00, z wyj. wt., czw., i sob. Wstęp wolny. Dojazd samochodem: z centrum jedzie się Savanorių prospektas (d. ul. Legionów), na rondzie przy Instytucie Fizyki skręcać w Galvės gatvė, z tej zaś po niespełna 5 min na lewo w Vilijos gatvė.