Kościół ten znajduje się na ulicy Skaryszewskiej. Wzniesiony został na fundamencie dawnej kaplicy mariawitów z początku XX w. W latach 20. ubiegłego stulecia mieścił się w tym miejscu skład materiałów budowlanych Szulca. Od 1927 r. jest to siedziba stołecznego ośrodka prac misyjnych księży Pallotynów. Zniszczony we wrześniu 1939 r., w ciągu niespełna dwóch lat został nie tylko odbudowany, ale też znacznie powiększony wg projektu prof. Stanisława Marzyńskiego. Wybudowano wówczas także pomieszczenia klasztorne. Poświęcenie odbyło się w listopadzie 1941 r. W latach 1946-48 wzniesiona została dzwonnica. Obecny kościół to wynik gruntownej przebudowy z lat 1985-88 wg projektu inż. Janusza Maliszewskiego. Konsekracja świątyni odbyła się w styczniu 1989 r., a pół roku później, w sierpniu 1989 r., poświęcono dolny kościół, kaplicę Matki Boskiej Częstochowskiej, gdzie umieszczona jest kopia Jej jasnogórskiego wizerunku. Na fasadzie kościoła umieszczona jest tablica ku czci żołnierzy VI Obwodu Praskiego AK poległych w latach 1939-1944. Z latami II wojny światowej związane są również tablice znajdujące się wewnątrz kościoła.