Jednym z wrocławskich zakonów byli sprowadzeni w XII w. joannici. O ich pierwszym kościele wspomina się już w 1320 r.
Istniejący dziś gotycki kościół zakonny Bożego Ciała powstał w XV w., później był kilkakrotnie przebudowywany, m.in. w 1700 r. przebudowano jego wnętrze w stylu barokowym. Ze względu na bliskie sąsiedztwo umocnień obronnych przejmowany był przez obrońców i różne armie zdobywające miasto. W latach 1875-1920 służył starokatolikom; parafią katolicką stał się ponownie w 1921 r. W trakcie walk o Wrocław w 1945 r. został poważnie zniszczony. Prowizorycznie zabezpieczony doczekał się odbudowy w latach 1955-1962.
Kościół Bożego Ciała jest jedną z trzech największych gotyckich świątyń Wrocławia. Znajduje się przy ulicy Świdnickiej.