Obecna, neogotycka, o szachulcowej konstrukcji świątynia powstała w 1852 r. jako zbór luterański. Istnieją jednak dokumenty świadczące, że w Marzęcinie wcześniej istniał zbór menonicki (okoliczni mieszkańcy wnosili opłaty na jego utrzymanie). Od 1945 r. kościół jest w zarządzie wspólnoty katolickiej. Jego wyposażenie, choć estetyczne, nie ma charakteru zabytkowego.