Tu na Wzgórzu św. Małgorzaty ma swój początek miasto Bytom. Około roku 1170 Bolesław Kędzierzawy ufundował w tym miejscu kościół murowany, który niestety został zniszczony przez husytów. Około 1600 roku zbudowano kościół drewniany, który przyłączono w tym samym wieku do parafii Wniebowzięcia Najświętszej Marii Panny. Aż do drugiej połowy XIX wieku kościół ten funkcjonował jako kościół cmentarny.
Gdy budowla groziła zawaleniem, w 1881 roku wybudowany został obecny, murowany kościół według projektu J. Kowollika. Parafię i Dom Misyjny prowadzą księża Werbiści. Data poświęcenia kościoła parafialnego: 07.06.1881 Odpust w kościele parafialnym: niedziela po 13 lipca.